Phân lập và thiết kế sgRNA chỉnh sửa  promoter OsSWEET11 liên  quan đến bệnh bạc lá trên lúa TBR225

TRẦN LAN ĐÀI, PHÙNG THỊ THU HƯƠNG, PHẠM HỒNG HIỂN, NGUYỄN THỊ THU HÀ, PHẠM XUÂN HỘI, NGUYỄN DUY PHƯƠNG.

Từ khóa

Bệnh bạc lá lúa, CRISPR/Cas9, OsSWEET11, TBR225.

Tóm tắt

Vi khuẩn Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) gây bệnh bạc lá ở lúa thông qua các protein TALE (Transcription Activator Like effector) để hoạt hóa các gen “nhiễm” (gen S - susceptibility gene) trong hệ gen cây chủ. OsSWEET11 thuộc họ gen mã hóa protein vận chuyển đường SWEET (Sugar Will Eventually be Exported Transporters) là một trong những gen S quan trọng của Xoo trên nhiều giống lúa. Để nghiên cứu vai trò của OsSWEET11 đối với tính mẫn cảm của bệnh bạc lá lúa giống lúa TBR225, vùng promoter OsSWEET11 dài 399 bp đã được phân lập từ ADN tổng số và nhân dòng vào vector pGEM-T. Promoter OsSWEET11 của lúa TBR225 phân lập được giống 99% so với trình tự tương đồng của giống lúa Nipponbare (japonica, mã số CP132242.1) và Zhenshan 97 (indica, mã số CP056059.1), chứa trình tự liên kết đặc hiệu với TALE PthXo1 của Xoo. Hai cấu trúc sgRNA sử dụng cho hệ thống chỉnh sửa gen CRISPR/Cas9 gây đột biến chính xác vị trí EBE (Effector Binding Element) PthXo1 trên promoter OsSWEET11 của lúa TBR225 đã được thiết kế bằng công cụ tin sinh. Kết quả nghiên cứu này có ý nghĩa quan trọng trong mục tiêu tạo giống lúa TBR225 kháng bệnh bạc lá bằng công nghệ chỉnh sửa gen.



Đã xuất bản

15/07/2024

Cách trích dẫn

Lĩnh vực

Chuyên đề