Xác định  đặc điểm, phân bố  trên nhiễm sắc thể,  phân loại và sự biểu hiện  của các gen mã hóa  protein PR1 liên quan  đến sự phát triển bệnh ở cây củ cải đường (Beta vulgaris L.)

CAO PHI BẰNG, NGUYỄN VĂN THIỆP, LÊ THỊ MẬN, NGUYỄN HUY THỊNH, TRỊNH THỊ KIM MỸ.

Từ khóa

Biểu hiện gen, cây phát sinh chủng loại, củ cải đường, pathogenesis-related 1 (PR1).

Tóm tắt

Nhóm protein liên quan đến sự phát triển bệnh 1 (pathogenesis-related 1, PR1) giữ nhiều vai trò quan trọng trong hệ miễn dịch thực vật. Nhờ sử dụng phương pháp tin sinh học, các đặc điểm hoá - lí, phân loại và biểu hiện của các gen mã hóa protein PR1 ở cây củ cải đường đã được phân tích. Tổng số 25 gen mã hoá BvPR1 đã được xác định trong hệ gen của cây củ cải đường (Beta vulgaris L.). Chiều dài các gen BvPR1 nằm trong khoảng 462 - 947 bp. Hầu hết (22/25) BvPR1 là các gen mã hoá liên tục, ba gen còn lại là gen phân mảnh, có chứa một intron. Các protein BvPR1 có chứa từ 131 - 237 axit amin, với khối lượng phân tử lí thuyết biến động 14,50 - 26,72 kDa. Đa số (16/25) BvPR1 có tính kiềm với giá trị pI nằm trong khoảng từ 7,46 - 9,53, trong khi đó, 9/25 BvPR1 còn lại có tính axit nhẹ với giá trị pI lý thuyết nằm trong khoảng 5,10 - 6,93. Phân tích cây phát sinh chủng loại cho phép phân chia các BvPR1 thành hai nhóm, nhóm A (9 gen) và nhóm B (16 gen). Các gen BvPR1 phân bố không đồng đều trên 6 nhiễm sắc thể của cây củ cải đường. Các gen BvPR1 có mô hình biểu hiện đa dạng ở rễ mẫn cảm và rễ chống chịu dưới ảnh hưởng của tuyến trùng Heterodera schachtii. Kết quả nghiên cứu này là cơ sở cho các nghiên cứu sâu hơn về chức năng của các gen PR1 ở cây củ cải đường nhằm phòng tránh một số bệnh trên đối tượng này.



Đã xuất bản

15/07/2024

Cách trích dẫn

Lĩnh vực

Chuyên đề